Рентгеновский дифрактометр Rigaku XtaLAB Synergy-S

Быстрый рентгеновский дифрактометр Rigaku XtaLAB Synergy-S с мультифокусным источником нового поколения PhotonJet-S и HPC детектором, идеально подходящий для любой кристаллографической лаборатории.



Предназначен для получения качественных данных с высокой точностью.

Качество данных, получаемых с помощью дифрактометра, наряду со скоростью и простотой метода измерения данных, является важнейшим фактором, определяющим результативность исследований. Ориентируясь на качественный конечный результат, корпорацией Rigaku был разработан дифрактометр XtaLAB Synergy-S, который сочетает качественно новые узлы с многозадачным программным обеспечением, инспирированным идеями пользователей, объединенные архитектурой высокой степени параллельности, что в итоге позволяет интеллектуальным образом быстро получать точные данные.

Дифрактометр XtaLAB Synergy-S состоит из одного или двух источников рентгеновского излучения PhotonJet-S (Mo, Cu или Ag), высокоскоростного каппа гониометра, детектора HPC или CCD и эргономичного корпуса с радиационной защитой. Помимо детектора HyPix-6000HE корпорации Rigaku и детекторов CCD, дифрактометр XtaLAB Synergy-S поддерживает также такие модели детекторов HPC компании Dectris Pilatus, как PILATUS3 R 200K, PILATUS3 R 300K и PILATUS3 R CdTe.

 

PhotonJet-S

В основе кристаллографической системы XtaLAB Synergy-S лежит новый источник рентгеновского излучения PhotonJet-S. Построенный на базе новой микрофокусной отпаянной трубки, предназначенный специально для исследования монокристаллов источник рентгеновского излучения, PhotonJet-S включает в себя также зеркало новой конструкции и новый механизм выравнивания.

По сравнению с предыдущей моделью новые источники рентгеновского излучения PhotonJet-S обеспечивают удвоенную плотность потока для всех трех типов мишеней.

Основной характеристикой источника рентгеновского излучения PhotonJet-S является наличие специальной внутренней системы охлаждения, которая поддерживает температуру анода с соблюдением строгих требований в отношении допусков. Для микрофокусных трубок важно, чтобы температура анода была постоянной, так как это позволяет исключить дрейф пучка.

HyPix-6000HE

Новый детектор HyPix-6000HE обладает многими преимуществами в области измерения монокристаллических данных. Речь идет о детекторе прямого действия, который не требует фосфора. Функция точечного распределения отражения определяется прежде всего размером пикселя, а не потускнением фосфора. При этом пиксель 100 μm позволяет уменьшить размер отражения и свести к минимуму перекрытие отражения и зону, в которой концентрируется фон.

Кадровая частота 100 Гц, почти нулевое мертвое время и сверхнизкий уровень шума детектора обеспечивает беспрерывный сбор данных. Еще одной существенной особенностью прибора является возможность снижения флуоресцирующего фона путем регулировки соответствующего энергетического порога.

  • В источниках рентгеновского излучения PhotonJet-S используются самые современные запаянные микрофокусные трубки, новейшая многослойная оптика и усовершенствованные механизмы юстировки;
  • Повышена скорость гониометра, и теперь возможно сканирование на скоростях до 10°/с;
  • В стандартном исполнении дифрактометр XtaLAB Synergy-S включает в себя HyPix-6000HE — детектор HPC с пикселями 100 μm, нулевым мертвым временем, исключительно низким шумом и частотой кадров 100 Гц;
  • В состав поставки каждого дифрактометра XtaLAB Synergy-S входит программа AutoChem 3.0. Одной из самых мощных функций AutoChem 3.0 является инструмент “What is this?” (“Что это?”), который позволяет достаточно быстро и точно определить молекулярную структуру задолго до полного сбора данных;
  • Электронная система управления яркостью кабинета и освещения кристаллов способствует получению оптимального видео изображения всех типов кристаллических образцов;
  • Отсутствие потребности в наружном водяном охладителе, что ведет к упрощению эксплуатации и уменьшению объема работ по техническому обслуживанию;
  • Онлайн-диагностика, а также поиск и устранение неисправностей расширяют возможности специалистов дистанционного обслуживания в контексте диагностики и выявления проблем;
  • Размеры: 130,0 (ш) x 187,5 (в) x 85,0 (г) см;
  • Масса: 550 кг;
  • Требования к питанию: 1Ø, 90-130V 15A или 180-260V 4A.

Явление дифракции рентгеновских лучей на кристаллах открыт Лауэ, теоретическое обоснование явлению дали Вульф и Брэгг (условие Вульфа-Брэгга). Как метод, рентгеноструктурный анализ разработан Дебаем и Шеррером. Метод позволяет определять атомную структуру вещества, включающую в себя пространственную группу элементарной ячейки, ее размеры и форму, координаты позиций атомов, степень заселённости этих позиций, и некоторые специфические свойства тех или иных групп атомов в элементарной ячейке. Рентгеноструктурный анализ и по сей день является самым распространенным методом определения структуры вещества в силу его простоты и относительной дешевизны.

Dimerization of long hibernation promoting factor from Staphylococcus aureus: Structural analysis and biochemical characterization

Konstantin S. Usachev, Bulat F. Fatkhullin, Evelina A. Klochkova, et al.

Journal of Structural Biology

Staphylococcus aureushibernation promoting factor (SaHPF) is responsible for the formation of 100S ribosome dimers, which in turn help this pathogen to reduce energy spent under unfavorable conditions. Ribosome dimer formation strongly depends on the dimerization of the C-terminal domain of SaHPF (CTDSaHPF). In this study, we solved the crystal structure of CTDSaHPF at 1.6 Å resolution and obtained a precise arrangement of the dimer interface. Residues Phe160, Val162, Thr171, Ile173, Tyr175, Ile185 and Thr187 in the dimer interface of SaHPF protein were mutated and the effects were analyzed for the formation of 100S disomes of ribosomes isolated from S. aureus. It was shown that substitution of any of single residues Phe160, Val162, Ile173, Tyr175 and Ile185 in the SaHPF homodimer interface abolished the ribosome dimerization in vitro.